A formação do município teve início ainda no século XVI, e se confunde com a própria história do povo brasileiro.
A freguesia Santo Amaro de Ipitanga, fundada em 1578, teve destaque na expulsão dos holandeses, entre 1624 e 1625, e na independência da Bahia. A Igreja Matriz, maior patrimônio arquitetônico da cidade, serviu como base de refúgio para os portugueses. A sua cultura foi forjada entre a casa grande e a senzala, das matrizes européias e africanas fermentadas nos engenhos de açúcar.